植物肽與動物肽的差異并不多。

在氨基酸組成和數量上的差異：動物蛋白中，一般都含有人體的8種氨1基酸，與人類的營養結構比較吻合；植物蛋白在缺乏免疫球蛋白，谷物缺乏賴氨酸等。

在被人體吸收方面：動物蛋白更易被吸收。  

優缺點方面：動物蛋白雖然容易被吸收，但其往往混有一定脂肪。

動物蛋白-主要來源于禽、畜、魚類和昆蟲等的。

靶向效應好。研究表明，動物的不同器官所含的小分子活性肽的種類、數量是不同的，心臟所含有的活性肽主要對心臟產生作用，而肝臟所含的活性肽主要對肝臟產生作用。同時，動物的不同器官有選擇性聚集了不同的微量元素，如心臟多含鈷、鋅，肝臟多含鐵，骨髓多含鈣、鎂等。

動物肽在功能方面比較單一，而植物肽確是比較多功能的。

動物肽活性高，比如牛骨肽為佳。這些蛋白質基料與人體蛋白質接近，屬好的蛋白質。這種蛋白質用植物蛋白酶催化出來的肽與人體合成肽極為相似，易被人體吸收，易發揮生理功能。

動物蛋白酶分解動物蛋白質生產出來的肽為佳。這種方法生產出來的多肽，不僅消除了動植物蛋白的過敏原，而且無任何化學殘基，沒有苦味、異味，其風味獨特，氣味芳香。

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